BIOINFORMÁTICA


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Bioinformática

El desarrollo de tecnologías de secuenciación masiva ha generado una gran cantidad de información a nivel biológico como genoma, transcriptoma, metaboloma, entre otros. La bioinformática es una disciplina que utiliza herramientas computacionales para analizar datos biológicos para apoyar en la solución de problemas globales y/o a gran escala, así como para profundizar en el análisis e interpretación de secuencias masivas. Debido a la creciente generación de datos biológicos, es importante desarrollar bases de datos de libre acceso que permitan interpretar la información de una manera sencilla.

¿Quiénes somos?

Este sitio web es parte del proyecto de investigación titulado “Integración de una línea de bioinformática para el análisis de datos genómicos”, con número de registro SIP21-023, el cual tiene como responsable al Dr. Guillermo Berumen Varela. El citado investigador es miembro activo del cuerpo académico CA-UAN-312 (Agrobiotecnología), adscrito a la Secretaría de Investigación y Posgrado, y en colaboración con el Centro de Transferencia de Tecnología e Innovación de la Universidad Autónoma de Nayarit se ha enfocado en el uso de herramientas bioinformáticas para analizar datos provenientes de plataformas de secuenciación masiva.

En esta plataforma se encontrarán servicios de análisis bioinformáticos, así como bases de datos ómicas libres para su consulta.

Servicios

Análisis proveniente de plataformas de secuenciación masiva.

❖ Transcriptoma RNA-Seq
  • Análisis de expresión diferencial de genes.
  • Ensamblado de Transcriptoma.
  • Anotación funcional de Transcriptoma.
  • Análisis BLAST.
❖ Precios:
*Los precios son individualizados, según los servicios que desee el interesado.

Base de Datos

Bases de datos consultables y de acceso libre.

❖ Annomics
Publicaciones y Eventos
Año Título Descarga
2021 Pathogenic Fungi Associated with Soursop Fruits (Annona muricata L.) during Postharvest in Nayarit, Mexico
2021 Differential Responses of Antioxidative System during the Interaction of Soursop Fruits (Annona muricata L.) and Nectria haematococca at Postharvest Storage
2020 Comparison of three genomic DNA extraction methods from soursop leaves (Annona muricata L.)
2020 Identification of Fungal Pathogens of Mango and Soursop Fruits Using Morphological and Molecular Tools and Their Control Using Papaya and Soursop Leaf and Seed Extracts
2020 Novel Edible Coating of Starch-Based Stenospermocarpic Mango Prolongs the Shelf Life of Mango “Ataulfo” Fruit
2020 Edible Coating Based on Roselle (Annona muricata L.) Mucilage Applied to Soursop Fruits in Postharvest Storage
2020 Identification of reference genes for quantitative real-time PCR in different developmental stages and under refrigeration conditions in soursop fruits (Annona muricata L.)
2020 Expression profile of EXP, Succ-CoA and ALDH genes in soursop (Annona muricata L.) fruits during ripening in response to refrigeration conditions
2019 Utilization of biotechnological tools in soursop (Annona muricata L.)
Contacto
❖ Dr. Guillermo Berumen Varela
  • guillermo.berumen@uan.edu.mx
  • +52 (311) 2118851
❖ LSC. Enrique Rafael Chávez Pacheco
  • enrique.pacheco@uan.edu.mx
  • echavez@cicese.mx

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